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辰山植物园新进纳米孔核酸测定仪即将投入运行

  基因测序作为目前常用的高新技术,在医疗和科研方面的应用广受瞩目。上海辰山植物园(上海辰山植物科学研究中心)于2018年利用专项经费购置了Oxford Nanopore公司出品的纳米孔测序仪GridION X5,并于12月10日完成安装调试和初级培训工作,即将投入使用。

  12月10日上午,特邀中国科学院植物逆境研究中心张蘅研究员、与实验室工作人员、仪器安装和培训工程师一同开箱清点合同约定的供货内容并开机测试,确认货物齐备、仪器完好。12月10日下午,工程师对仪器技术和基础应用、数据处理等进行了培训,20余人参与。GridION能够在48小时内生成100 Gb的数据,并具有全面的数据处理能力。GridION X5系统的测序部分包含五个流动槽。这些流动槽可单独使用或协同使用,并通过USB连接到计算机。与所有的纳米孔测序一样,它没有固定的运行时间。计算机可以控制五个流动槽。系统运行新一代的GPU以及Linux操作系统。此外,纳米孔核酸测序仪是目前唯一一类能对核酸分子本身进行实时数据测定和分析的核酸测定仪,即无需进行PCR或DNA酶合成等过程,因而可以减小误差,真实反映核酸分子序列的情况,且不受核酸分子长度的影响,目前单条测定能达到2.5Mb长度。

  该仪器将在服务于辰山科研中心各课题组的研究需要的同时通过上海研发公共服务平台向社会共享服务。

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